Pertanian organik bersifat ramah lingkungan karena menggunakan bahan-bahan yang alami sehingga menghasilkan produk-produk yang sehat, bergizi dan aman dikonsumsi. Beberapa keuntungan dalam penerapan sistem pertanian organik adalah sebagai berikut:
keuntungan penerapan pertanian organik
  • Meningkatkan hasil pertanian dalam jangka panjang melalui input yang terjangkau karena memanfaatkan keanekaragaman hayati lokal. 
  • Meningkatkan mata pencaharian baru seperti pembuatan pupuk dan pestisida alami dan keamanan pangan yang sehat dan aman dikonsumsi. 
  • Membangun ketahanan pertanian terhadap perubahan iklim. 
  • Mengurangi resiko keuangan karena menggunakan input sumber daya yang terbarukan dan tersedia secara lokal. 
  • Mengintegrasikan praktek pertanian tradisional seperti integrase ternak-karet dan sejenisnya. 
  • Memungkinkan adanya peluang pasar baru baik dari pasar dalam negeri maupun pasar luar negeri. 
  • Menyediakan ketahanan sistem pertanian pada saat iklim ekstrem seperti musim kekeringan atau musim hujan yang terus menerus. 
  • Meningkatkan kesehatan manusia karena produk yang dihasilkan menyehatkan dan terhindar dari racun. 
  • Berkontribusi pada mitigasi perubahan iklim karena membantu mengurangi emisi gas rumah kaca dan menyerap karbon dalam tanah.